A Fundação Luso-Portuguesa Rei Afonso Henriques é uma instituição de caráter privado com participação pública, estabelecida através de escritura pública em 7 de fevereiro de 1994. Esta fundação foi registrada no Registo de Fundações de Espanha através da ordem nº 26379 de 31 de outubro do mesmo ano, e o seu reconhecimento foi publicado no Diário Oficial do Estado em 29 de novembro de 1994.

Em Portugal, a Fundação também obteve reconhecimento como Pessoa Coletiva de Utilidade Pública, através de um despacho emitido pelo Primeiro-Ministro e publicado no Diário da República, na sua IIª série nº 29 de 4 de fevereiro de 1999.

Um marco significativo para a Fundação foi a sua distinção com o Alto Patrocínio do Presidente da República de Portugal em 25 de julho de 1995, uma honra que enriquece o seu compromisso e contribuição para ambas as nações.

Em 1994, um grupo de pessoas, incluindo tanto indivíduos como representantes de instituições públicas e privadas de Espanha e Portugal com ligações nos domínios cultural e empresarial, uniu-se para fundar a Fundação Rei Afonso Henriques (FRAH). 

Nesse momento, estabeleceu-se a instituição que, como mencionado anteriormente, obteria o seu reconhecimento oficial em Espanha e Portugal através dos procedimentos legais correspondentes.

A partir desse momento, estruturou-se a organização da FRAH, aprovaram-se os seus estatutos, definiram-se os seus regulamentos internos e delinearam-se de forma clara os seus objetivos e propósitos.

Estes objetivos visam contribuir para o bem-estar das pessoas em toda a Bacia Hidrográfica do Douro, assim como fortalecer as relações culturais, sociais e económicas entre o Norte de Portugal e a Comunidade de Castela e Leão.

Com este propósito, desenvolvem-se diversas iniciativas e projetos concebidos para promover a cooperação na zona fronteiriça e fomentar a compreensão mútua, aproximando as realidades destas regiões geográficas.

Para realizar todas as suas atividades, era essencial ter um espaço emblemático. Assim, chegou-se a um acordo para adquirir, reabilitar e equipar o antigo Convento de São Francisco extra-Ponte na cidade de Zamora. Este espaço histórico mostrou-se ideal para desenvolver todas as iniciativas da Fundação. A colaboração entre a Diputación de Zamora, a Junta de Castela e Leão e a União Europeia através do seu programa INTERREG II tornou possível a criação da sede da Fundação.

A Diputación de Zamora, como proprietária do edifício, cedeu-o à FRAH para cumprir os seus fins fundacionais. A inauguração desta sede teve lugar em 31 de outubro de 1998 e contou com a presença de representantes da União Europeia, da Junta de Castela e Leão, da Diputación de Zamora e de todos os membros que faziam parte do Patronato da Fundação naquele momento.

É importante destacar que, como instituição binacional, a FRAH tem também uma sede na cidade de Bragança, Portugal.

Ao longo destes anos, a FRAH desenvolveu inúmeras atividades, como é evidenciado nas suas Memórias Anuais. Estas atividades contaram com o apoio tanto do Patronato como da União Europeia, através de vários programas de natureza económica, social e cultural.